Studium v doktorském studijním programu (DSP) je určeno absolventům vysokých škol, kteří ukončili studium předepsanou státní zkouškou v oboru, na který DSP navazuje nebo v oboru příbuzném. Základním cílem DSP je získat a prokázat schopnost samostatné vědecké práce v daném vědním oboru zpracováním a obhajobou disertační práce, publikacemi a dalšími formami prezentace vlastní vědecko-výzkumné činnosti, včetně vykonání všech předepsaných zkoušek a státní doktorské zkoušky. Seznamy studijních programů naleznete níže.
Studium je organizováno ve dvou formách – prezenční a kombinované. Prezenční forma studia je hlavní formou doktorského studia a hlavním zaměstnáním doktoranda. Studenti prezenční formy mají postavení studentů vysoké školy a po dobu studia je jim měsíčně vypláceno doktorské stipendium. Kombinovaná forma studia je oproti tomu formou doktorského studia určenou především pro uchazeče z praxe nebo z řad pracovníků fakulty, přičemž zůstávají nadále v pracovním poměru svých zaměstnavatelů.
Absolventům DSP se přiznává akademicko-vědecký titul "doktor" (ve zkratce „Ph.D.“ uváděno za jménem).