V souladu se zákonem o vysokých školách č. 111/1998, § 59, ods. 5, a na základě rozhodnutí děkana příslušné fakulty je studium v cizím jazyce na ČZU zpoplatněno. Výše poplatku je určena Statutem ČZU a je uvedena v připojené tabulce (liší se dle fakult, stupně studia, ev. i konkrétních studijních programů). Poplatek je stanoven vždy na každý započatý rok studia.
Rozhodnutí o vyměření poplatku za studium v cizím jazyce vydává děkan fakulty a poplatek je splatný před zápisem do studia, nebo před zápisem do studia vyššího ročníku. Rektor může na žádost studenta v odůvodněných případech poplatek snížit, prominout nebo odložit. Žádost student podává prostřednictvím studijního oddělení fakulty, na které studuje. Poplatky lze hradit převodem na účet ČZU, nebo v hotovosti na pokladně ČZU.